מוזיאון עתיקות הגולן בקצרין מציג ממצאים שחלקם מתהדר בגיל המתקרב לחצי מיליון שנים. במוזיאון מיוצגות כל התקופות ההיסטוריות בשחזורים, הסברים אורקוליים והולוגרמות, עם דגש על ימי המשנה והתלמוד, בתי הכנסת ובתי המדרש של התקופה
המתעניין בפסלים ובאמנים שהיו כאן אלפי שנים לפנינו, יכיר אותם ואת יצירתם במוזיאון עתיקות הגולן בקצרין, שגיל הקדומים בממצאיו מתקרב לחצי מיליון שנים.
תקופת הפרהיסטוריה מוצגת באמצעות איורים ותמונות של גולגולת פיל שנמצאה ליד גשר בנות יעקב, שרידי פילים נמצאו על גדת הירדן במקום בו היה חוף אגם החולה בימי קדם. בבקעת קוניטרה נחשף מצבור של עצמות בעלי חיים, בהם קרנף, פרות בר גדולות, סוסים, אריה, צב, אייל אציל, צבי וזאב.
התקופה הכלכוליתית מיוצגת במוזיאון בבית טיפוסי משוחזר. על יסוד חפירה וחקירה של 25 אתרים בגולן הגיעו למסקנה כי בתי התיישבות קדומה זו היו בנויים מאבני הבזלת המקומיות, ללא עיבוד. המבנים היו גדולים: רוחבם כ-6 מטרים ואורכם כ-15 מטרים. הקירות התנשאו מעל לקומת אדם והגג עשוי מקורות עץ מכוסות בבוץ וקש. ממצאים ייחודיים בעולם נחשפו כאן: פסלי בזלת דמויי תייש, שעל ראשו שקע להקרבת מנחה לאלים, כנראה אליל בית.
גלגל רפאים – אתר ייחודי לגולן. גלגל רפאים הנו מערכת של של חומות אבן בנויות במעגלים חד-מרכזיים אשר שימש למטרות פולחניות. במוזיאון ישנו דגם של האתר עם הסבר אורקולי מלווה בהולוגרמות.
הדולמן – "שולחן אבן" – העשוי מאבנים ענקיות, שימש כנראה כקבר לפני כ-4,500 שנים. מאות דולמנים פזורים בגולן, ודולמן מטיפוס בינוני הובא אל גן המוזיאון וניבנה מחדש במדויק.
גמלא – גמלא מוזכרת במקורות כעיר מוקפת חומה עוד בימי יהושע בן נון. היא הייתה עיר יהודית פעילה החל משנות השמונים שלפני הספירה ועד לשנת 67. גמלא הצטרפה אל ערי הגליל במרד הגדול ברומאים ותושביה לקחו חלק פעיל בהגנה על עירם. הקרבות שהתנהלו כאן וגבורת הלוחמים נסקרו בהרחבה בספרו של יוסף בן מתתיהו "מלחמות היהודים". במוזיאון מוקרן חיזיון אורקולי המתאר את שלבי המרד, המצור והקרבות עד הסוף המר. בין הממצאים שנתגלו בגמלא ומוצגים במוזיאון, קנקנים לשמן ולמים, נרות שמן רבים, תכשיטים, ראשי חצים, אבני בליסטראות, ומטבעות רבים ביניהם המטבע החשוב 'לגאולת ירושלים'. מטבע זה נטבע בגמלא כנראה בעצומו של המרד הגדול, בשנת 66 לספירה.
ימי המשנה והתלמוד – תקופה זו היא העשירה בממצאים בגולן, שחלקם מוצגים במוזיאון ובגן שמחוצה לו, ביניהם פריטי בנייה מבתי הכנסת ועליהם תבליטים של מנורת המקדש, שופר, מחתה וארבעת המינים. מוצגות גם כתובות החקוקות בעברית או בארמית על גבי מצבות. כתובות אחדות מבתי הכנסת מוקדשות לתורמים או לאישים חשובים. החשובה שבהן היא כתובת עברית על גבי משקוף מעוטר מהכפר דבורה המזכירה את רבי אלעזר הקפר: "זה בית מדרשו של רבי אליעזר הקפר". בתצוגה דגם 1:50 של בית הכנסת העתיק בקצרין ולידו ממצאים שנתגלו באתר: מטמון מטבעות, אבני פסיפס, כלי חרס ורעפי גג.
המוזיאון סוקר את העתיקות המתייחסות לנוצרים שהתגוררו בגולן, בדרך כלל ליד ים כנרת. בעשרות כפרים נוצריים שנסקרו בגולן נמצאו אבנים מעוטרות רבות. כן נמצאו כתובות יווניות רבות על גבי משקופים, או על מצבות קבורה.
